張鴻章 系主任
民國74年8月至民國80年7月
本系學士班成立於民國七十四年，參加大學聯考第一類組招生；研究所於民國七十九年起招收學生，民國八十二年起招收博士班學生。會計學系成立之初，幸世間教授極力推薦兼具學術研究及行政能力的張鴻章教授擔任會計系系主任（74.8-80.7）。當時全臺灣的會計學界僅有兩位會計博士（鄭丁旺與杜榮瑞博士）；同時美國正值會計師資不足之際，但教師薪津相較於臺大高出許多，因此造成國外學成的會計博士回臺任教的意願不高。有鑒於此，為提升臺灣會計學界的品質，張鴻章主任向業界募款設立講座，提供老師薪津之外的津貼。
張鴻章主任於其任內積極充實會計系的師資陣容，陸續自國外聘任許多優秀教師以及自美國招聘許多會計學博士。當時王泰昌教授首先回國，並自政大邀請杜榮瑞教授，之後尚有蔡揚宗、柯承恩、吳琮璠、蔡彥卿及林嬋娟等教授亦回臺任教，帶動臺灣會計學界的蓬勃發展。
為促使臺灣能夠自行培育優秀師資，張鴻章主任極力鼓吹成立博士班，並堅持應給予與國外相同之訓練，必修經濟研究所之部分課程；同時在當時臺灣會計學界都還是一片以「純會計」為傲的潮流之下，張鴻章主任即主張臺大會研所碩士班的學生必須是 "MBA majoring in accounting" ，擴展除會計之外的管理知識。
此外，張鴻章主任開創「會計理論與實務研討會」，最後促成「中華會計教育學會」的誕生。近年來，中華會計教育學會舉辦多場年會，年會收錄多項論文，並設有國際性研討會、專題演講、教育座談會以及實務座談會。張鴻章主任亦為年會之主講人，分享 "System Thinking" 等重要主題，已成為臺灣會計學界專業且重量級的學術交流平台之一。中華會計教育協會薛敏正理事長於2019年年會上，頒發第二屆會計終身成就獎給張鴻章教授，表達感恩與敬重。
鑒於會計系學生不善溝通者所在多有，張鴻章主任於是提議舉辦大會盃辯論比賽。在會計研究月刊林日峰社長以及謝淑惠小姐等的協助之下，第一屆的大會盃會計辯論賽順利開辦，至民國九十七年已舉辦了二十屆。
杜榮瑞 系主任
民國80年8月至民國83年7月
民國八十年八月杜榮瑞教授出任會計系系主任（80.8-83.7），任內推動全系於教學研究上的發展，並籌劃一系列的會計理論與實務研討會。並促成本系與美國會計學會理事會合辦會計學術研討會；對於我國會計學術與國際重要會計團體的交流功不可沒。
杜主任任內對於會計學系發展的主要貢獻包括：將原隸屬於商學研究所內的會計組，經向教育部申請後，將會計學博士班改設置於會計學研究所下；針對初設立之會研所博士班，因應不同學生之不同背景，確立應必修、補修之課程規劃，並舉行課程規劃之公聽會。此外對於延續商研所會計組而來的會研所碩士班亦明確規定應修習之五管課程；積極招募優秀學子進入臺大會研所就讀；確立會研所MBA取向之教學方向；大量聘任優秀教師以豐富師資，於此期間一共聘任包括朱立倫、林世銘、李書行、陳國泰、葉疏、劉順仁等老師，以豐富會計系教學資源。
杜榮瑞主任一方面提升臺大會計系之學術地位，增進與實務界之雙向溝通，另一方面亦提供會計學者發表學術研究成果的機會，增進學術視野及研討空間；初步確立大學部之課程並要求系所內所有學生當面繳交選課單予系主任，以增加師生間互動並了解學生之學習狀況；確立臺大管理論叢之學術地位，嚴格匿名審稿、詳細確立論文格式以維持體例之一致，且透過矩陣模式以確保審稿公平。
柯承恩 系主任
民國83年8月至民國86年7月
民國八十三年八月柯承恩教授出任會計系系主任（83.8-86.7）。柯承恩主任為建立會計系所長期發展的架構與策略，於上任之後便積極籌劃召開會計系首次之系所發展策略會議。在民國八十三年的第一次會議中，除了邀請全系教師外，並邀請產業界專家參與，充分溝通社會經濟變化對會計系所發展的影響，如何建立系所的特色，以發揮更大的貢獻。會中擬定系所未來在教學、研究、社會服務等各方面的願景、方向、策略等共識，建立發展藍圖。爾後每年持續召開系所發展策略會議亦進一步強化會計系所發展的共識，也成為會計系長期發展的一大特色。在研究方面鼓勵教師研究的多元化發展，並且對於本國的會計問題作更深入的探討，協助解決國內產業發展所面對的會計問題。課程方面，鼓勵創新課程，包括偕同教師到新竹科學園區之科技公司開發新課等，促使學術與實務的進一步結合。
為了加強學生在功課之外的團隊與領導能力，柯主任密切的與會計學會幹部及各班代表會面溝通，鼓勵學生參與社團與系上舉辦的各種活動，包括國內與國際的研討會。促使學生在校就能學習組織運作的管理能力、養成服務他人的精神以及溝通協調的能力。同時為了鼓勵優秀學生出國進修，擴大國際視野，特別規劃與美國伊利諾大學香檳校區會計系合作，由伊利諾大學提供本所研究生到該校研讀同時取得該校會計碩士學位的機會。由於臺大以往尚未有類似取得雙學位之合作經驗，經過多方努力，溝通協調終於獲得學校同意，得以在民國八十六年八月由繼任蔡揚宗主任順利正式簽定合作協定。
蔡揚宗 系主任
民國86年8月至民國89年7月
民國八十六年八月蔡揚宗教授出任會計系系主任（86.8-89.7）。蔡揚宗主任積極拓展國內外師生交流，於民國八十六年，與美國伊利諾大學香檳校區簽訂合作計畫，提供機會給本所碩士班學生，在伊利諾大學取得會計學碩士學位(MSA)。同時與美國伊利諾大學於臺北世貿國際會議中心，合辦第八屆會計理論及實務研討會。
蔡揚宗主任任內會計系獲獎連連，包括杜鵑花節網頁設計比賽獲院長獎、全國大專盃會計專業辯論比賽連續三年冠軍、龍騰盟學生交流比賽連續二年冠軍等。
在學術活動方面，蔡揚宗主任也鼓勵會計系教師出國進修，補助本系教師出國參與研討會。例如民國八十七年，會計系十多位老師參加AAA年會，並在San Diego辦歡迎會，為該會參加人數最多者（世界各著名大學系主任幾乎都參加）；促成Merill Lynch, Goldman Sachs至系上徵才；引進Rutgers大學Raw Mirror Site，使得臺大會計系全球資訊網有別於一般系所網頁，除了本系的詳細介紹、系所資訊外，另收集整理國內外網站上會計資源，並設有Rutgers Accounting Web (RAW)分站，為當時網路上內容最豐富的中文會計資訊站；將會計系募款對象由會計師事務所延伸至一般產業界。
林嬋娟 系主任
民國89年8月至民國92年7月
民國八十九年八月林嬋娟教授接任會計系系主任（89.8-92.7），任內庚續會計系的傳統，舉辦多項學術研討會，展現臺大會計學系於國內會計業界的學術領導地位。為了引進與會計研究相關之國際研究知識與經驗，增進會計系所老師及博士之研究成果， 會計學系在台大商學會計文教基金會及熱心校友的贊助下，於九十年底設立「臺大會計研究講座」。首位講座教授係由美國耶魯大學教授Shyam Sunder擔任，為期兩年，Sunder於九十一年暑假蒞臨會計學系指導兩週，藉由與國際大師級學者的互動，相信對激發會計系師生的研究潛能有相當的助益。除了引進大師，林主任亦非常鼓勵老師參與國際學術活動，任內積極募款補助多位老師、博士生出國參加研討會或從事研究。對研究所需之資料庫增添亦不遺餘力，企盼能給師生塑造良好之研究環境。
鑑於師資的充實乃教學研究的關鍵，會計學系於民國九十年八月與中研院合聘副院長朱敬一院士，教授經濟學，另於九十一年二月與國企系合聘林修葳老師。專任教師共增聘三名：劉嘉雯老師、廖珮真老師及在香港任教多年的資深教授董水量老師。林主任推展國際交流，促成與夏威夷大學教授之交換，夏大的Tom Pearson教授到會計系客座，李書行老師則到夏大任教。Pearson在臺大兩學期，以英文授課，其教學認真與學生互動密切，頗受學生好評。林主任亦延聘香港科技大學陳建文教授、長庚大學管理學院吳壽山院長及幾位實務界人士擔任兼任教師，使會計學系的課程理論與實務兼備。
林主任對於學生的學習及生活極為關心，每學期均輪流與各年級座談或舉行「系主任時間」，與學生面對面的溝通，瞭解學生的問題及需求。此外，林主任會邀請畢業的學長姐到課堂中分享職涯經驗、會計實務，也舉辦「學思歷程經驗分享」、「就業、進修」等座談。九十一年九月開學時，更舉辦會計系第一次「親師座談」，邀請新生家長參加，九十二年六月亦舉辦首次「會計學系畢業典禮」，提供老師與家長互動之機會，這兩項活動，非常有意義，獲得家長、學生與老師熱烈的迴響。
蔡彥卿 系主任
民國92年8月至民國95年7月
民國九十二年八月蔡彥卿教授接任會計系系主任（92.8-95.7）。其任內極力推動研究生參與相關學術活動，亦戮力規劃相關的研討活動。
推動研究生參與學術活動部份，盡力協助博士生參與中華會計教育學會學術活動，使其獲得更多會計學術教育資源，並得參加相關學術研究活動。在系上研究空間配置部份，特別規劃建置博士生專屬之個人研究空間，並且給予個人研究使用OA家具以及個人專屬電腦促使博士生能安心且專心研究；此外建置博士生共同研究之多功能研究空間，以提供博士生多方討論的可能。
軟體設施部分，新購教學研究需要之軟體及資料庫，如Compliance Week線上財會資訊資料庫、SAP Business One會計資訊系統使用之企業資源規劃（ERP）軟體資料庫、IAS國際財會準則線上資料庫等。除了提供研究生研究使用，對於大學部學生亦可多加學習相關的會計軟體。
且為因應時勢，於92年舉辦「平衡計分卡在政府部門的運用研討會」促成官、學雙方交流。於會計專業部分，於其任內舉辦多次相關研討會，如「九十三年國內主計學術專題研討會」、「35號公報研討會」、「2005會計理論與實務研討會」、「34號公報宣導說明會」和「負債與業主權益之區分研討會」。93年邀請美國亞利桑那大學會計系James Ohlson教授至系所擔任國際會計講座教授、紐約大學會計系Joshua Ronen教授至系所擔任訪問教授，並對系所博士生進行授課；這些活動促使會計系學生得以習得較新的會計相關知識。
李書行 系主任
民國95年8月至民國98年7月
民國九十五年八月李書行教授接任會計系系主任（95.8-98.7）。李書行主任任內致力於提升臺大會計系之國際化程度，三年來邀請多位國際知名學者，例如：The Accounting Review（國際三大會計期刊之一）總編輯Dan Dhaliwal、The International Journal of Accounting總編輯Rashad Abdel-Khalik等，至系所進行短期訪問、學術研討及專題演講，對於提升臺大會計系師生之國際視野極具貢獻。另外，臺大會計系亦於民國九十六年十二月爭取到「The 2007 APJAE Symposium on Accounting in Honor of Professor A. Rashad Abdel-Khalik」研討會的主辦權，此次研討會共有近二十位外國學者與會，國內多所大學會計學系教授亦共襄盛舉，對於提升臺大會計系之國際學術地位亦貢獻良多。
為再強化本系師資，李書行主任任內增聘王全三、許文馨、陳耀宗、曾智揚、李艷榕與廖芝嫻六位優秀教師。本系專任教師中，有多位國外知名大學博士和1位國內博士亦於聘任前即符合本系聘任國內博士須具備有會計領域SSCI期刊論文發表成果之條件而聘任之，師資陣容可謂十分堅強充實。
近年來本系陸續敦聘國內四大師事務所負責人為兼任實務教師，以結合會計理論與實務，增加學生學習會計實務之機會。另外，李書行主任任內引進美國伊利諾大學之Project Discovery教學理念，強調以觀念理解會計，用個案討論、小組活動、專題探討等解決問題為導向的方式進行課程，以激發學生對於知識的需求與養成學生持續學習的理念。
有鑒於近年我國出國進修高等學位之人數持續減少，會計領域亦有類似的情況，為提升本系畢業生的教育水平，臺大會計系於九十六學年度修改民國八十六年與美國伊利諾大學香檳校區所簽訂的學術合作備忘錄，讓本系大學部學生完成臺大學業後亦得直接申請至國外進修碩士學位，並且另外再與德州大學達拉斯分校簽下合作計畫，使會計系成為第一個規劃跨國雙聯學位的臺大系所。
為協助學生克服昂貴留學費用的問題，本系與德州大學達拉斯分校的雙聯學位計畫，尋求安永會計師事務所的支持，透過「培育會計菁英海外深造計畫」，贊助出國留學而將來返回安永服務五年的臺大會計系學生每人三萬美元的補助，以減輕學生出國費用的負擔。順利和伊利諾和德州大學簽下合作，是臺大會計學系邁向國際化的新紀元。
林世銘 系主任
民國98年8月至民國101年7月
民國九十八年八月林世銘教授接任會計系系主任（98.8-101.7）。林世銘主任任內不僅重視國內外的學術交流，對於兩岸之間的學術交流也不遺餘力。在其任內首次和北京大學光華管理學院舉辦「北大臺大會計學術交流研討會」，之後也舉辦「第二屆上海財經大學、香港城市大學、臺灣大學聯合會計研討會」，為國際優秀華人學者提供溝通交流的平台。另外，臺大會計系和美國伊利諾大學、政治大學共同舉辦「2010美國伊利諾大學國際會計學術研討會」，自2003年起，伊利諾大學邀請世界會計名校協辦，並在不同國家舉辦研討會，此次為首次在臺灣舉辦，臺大會計系能夠得到協辦權，表示國際學術界對於本系的肯定，也藉此次研討會的機會，再次提升臺大會計系的國際學術地位及能見度。
優秀的師資為臺大會計系之根本，林世銘主任任內積極聯繫於國外的優秀學者，增聘專任教師吳淑鈴老師、劉心才老師和滝西敦子老師。林世銘主任為獎勵臺大會計系新進專任教師進行學術研究，協助我國培育新一代具重大影響力之會計研究學者，與台大商學會計文教基金會共同訂定「獎助臺大會計系教師進行學術研究辦法」，期盼能以此提升會計學術水準。
林世銘主任同時也致力於鼓勵學生的專業能力及外語能力發展。其任內多方募款，獲王金山會計師捐款獎勵一次考上會計師之學生，而設立「一次考取會計師天才獎」，並且勤業眾信會計師事務所之本系校友也捐款鼓勵托福語文能力測驗表現優秀學生，而設立獎助學金，盼能協助本系學生成為會計師事務所、企業、政府部門的國際菁英人才。除此之外，林世銘主任對於轉系生和僑生也十分關心，特別為轉系生、僑生舉辦座談會，希望能夠協助轉系生和僑生提早適應和瞭解臺大會計系。
劉啟群 系主任
民國101年8月至民國104年7月
民國一百零一年八月劉啟群教授接任會計系系主任（101.8-104.7），劉啟群主任任內極為重視臺大會計系教學及研究的發展，除多次舉辦研討會和論壇，還於102年成立「臺大幸世間會計研究中心」。「臺大幸世間會計研究中心」為紀念已故幸世間教授，感謝其對於臺大會計系的卓越貢獻，為發揚其信念及志業，特設立此中心，中心敦聘國際知名學者MIT Ross Watts教授擔任中心創立首任主任。中心主要工作職掌為透過研究與教學，以及其他學術研究、實務活動，以期因應國際會計環境變化的需求，並強化臺灣與國際學術合作之機制，提供一個會計理論與實務交流的平臺，加速臺灣會計學術國際化之發展。
劉啟群主任任內舉辦「第26屆會計菁英盃辯論比賽暨2014海峽兩岸大學會計辯論邀請賽」，海峽兩岸大學會計辯論邀請賽為傳統悠久的辯論賽事，是臺灣會計界每年一度的盛世，受到包括四大會計師事務所在內的多家會計實務與研究機構的關注與支持。臺灣會計辯論賽的大學優勝隊伍和中國著名大學的會計學專業學生參與的傳統辯論大賽，為海峽兩岸大學會計學專業的學生提供良好的交流平台。
劉啟群主任持續為系上師資增添新的生力軍，增聘陳坤志老師、尤琳蕙老師和高偉娟老師。劉啟群主任同時為鼓勵學生更精進於學業，培養更多卓越菁英學子，募款頒發書香獎助學金與本系成績表現優秀學生。
劉嘉雯 系主任
民國104年8月至民國107年7月
民國一百零四年八月劉嘉雯教授接任會計系系主任（104.8-107.7），劉嘉雯主任任內臺大會計系與臺灣會計教育基金會共同發行《會計審計論叢》期刊，以促進臺灣會計教育發展為宗旨。目標為促進學術研究發展，做為會計、審計及其他相關領域(如租稅、財務、金融等)學者分享研究成果之平台。
劉嘉雯主任任內為推動國內會計學界投入本土資料的研究舉辦「臺灣本土資料應用於會計領域研究研習營｣，針對審計、財務會計、管理會計、財政資訊及大數據商情與治理資料五大專業領域進行研討，透過此次研習營，讓臺灣會計學者集思廣益，思考如何尋找與應用可利用的本土資料，及使用本土資料於國際期刊發表時應注意的事項與技巧，對於國內會計學者將本土會計研究推向國際有莫大助益。
為配合時代發展及社會人才所需，劉嘉雯主任舉辦「課程策略會議」，邀請順達科技鍾聰明董事長、KPMG林琬琬會計師，以及美國Arizona State University的貝克偉教授，結合國內外學界及業界實務的專家學者，與系上教授群一同討論未來的課程方向規劃與內容設計。盼能透過新的課程規劃，結合學校的豐富資源，提供學生多元的學習機會，強化學校課程訓練與未來職涯發展的連結。因此本系為鼓勵學生跨領域學習，學生如在財務金融、法律、資訊管理三個領域其中修習滿一定學分，系上便會頒發第二領域證書與以證明。
劉順仁 系主任
民國107年8月至民國113年7月
民國一百零七年八月劉順仁教授接任會計系系主任（107.8-113.7），劉順仁主任任內積極推動會計教育的數位轉型，於民國108年將臺大會計學研究所碩士班分組為甲組(主修會計)和乙組(主修商業智慧與資料分析)且開始招生。劉順仁主任於此同時也舉辦一系列「商業智慧與數據分析演講」，首先邀請美國耶魯大學Shyam Sunder教授蒞臨本系演講，談論人文學科對專業教育的重大貢獻。接著邀請加州大學戴維斯分校(UC Davis)的蔡知令講座教授蒞臨本系演講，談論統計學與大數據、機器學習、人工智慧的關係。憑藉此些規劃使會計教育能與時俱進，在數位技術突飛猛進的時代中，更充分發揮會計專業的價值。
劉順仁主任任內，臺大會計系舉辦「2019中華會計教育學會年會」，為臺灣會計界一大盛會，本次年會的專題演講分別邀請美國會計學會前主席 Marc Robin 教授，以及臺灣大學會計學系張鴻章名譽教授擔任主講人，張鴻章名譽教授為本系的創系主任，同時張教授獲頒「第二屆會計教育終身成就獎」，以感謝其對於會計教育的貢獻。透過此次年會的發表與討論，相信能讓每位與會者更努力邁進，並推動會計界的新紀元。
劉順仁主任從上任起，便積極增聘專任教師，黃祥宇老師和謝昇峯老師皆為此時期增聘，目前也持續聯繫國外的優秀學者，希望年輕的師資，能夠帶來新的知識能量，成為臺大會計系下一波成長的主力。
在劉順仁主任的支持下，本系期刊《會計審計論叢》榮獲國家圖書館頒發「期刊即時傳播獎」：管理學學門期刊 第二名，民國110年榮膺科技部人文社會科學研究中心評比為社會科學核心期刊（TSSCI）第二級。
學生方面，劉順仁主任為學生爭取到台灣積體電路製造股份有限公司(台積電)暑期實習的機會，進行利用機器學習分析技術在會計領域應用的專案。為協助清寒學生，向各界募款創立獎助學金，台積電何麗梅歐亞業務資深副總經理捐款創立「何麗梅女士獎助學金」，臺大EMBA會管學會捐款創立「臺灣大學EMBA會管學會獎助學金」、勤業眾信聯合會計師事務所 鄭旭然會計師兼策略長捐款創立「國立臺灣大學會計學系書馨獎獎助學金」。
